Secondo la tradizione la chiesa fu edificata per volontà di San Francesco di Assisi in occasione di una sua sosta a Mondavio nel XIII secolo. Nel corso dei secoli, subì numerose trasformazioni fino a giungere alle attuali forme nel 1700: un’architettura semplice e maestosa al’’esterno e barocca all’interno. All’interno si ammirano i quadri dei fratelli Persiutti di Fano. Il prospetto è rustico, con laterizio faccia a vista e contrafforti ai lati. Di particolare interesse sono il campanile affusolato a forma di pannocchia e, uscendo dalla chiesa a destra, il chiostro dell’ex convento, a diciotto arcate a tutto sesto e coperte da basse volte a crocera intonacate.