La scoperta dell’ingresso della Grotta del Fiume avvenne, in maniera casuale, il 28 giugno 1948 da parte di Mario Marchetti, Paolo Beer e Carlo Pegorari del Gruppo Speleologico Marchigiano. Si trovano qui tracce della frequentazione sporadica dell’Uomo durante il Paleolitico superiore, conferendo alla grotta un’importanza storica elevatissima.Solo dopo più di vent’anni, con la nuova generazione di speleologi si scoprì, ad una quota molto più elevata, l’ingresso alla Grotta Grande del Vento, che permise l’entrata nel cuore della montagna. La Grotta del Fiume, con due ingressi che si aprono quasi al livello del corso attuale del torrente Sentino, si sviluppa su più piani ad andamento labirintico e comunica con la Grotta Grande del Vento. Da S.Vittore di Genga si prende la statale che porta verso Sassoferrato ed attraversa la Gola di Frasassi. L’'ingresso artificiale del sistema sotterraneo si trova qui ed inizia con la traversata dalla Grotta Grande del Vento alla Grotta del Fiume. Un altro ingresso della Grotta si trova più a valle ed è anche visibile, poco sopra il pelo dell'acqua, dalla strada delle Gole. Dal 20/06/2001 un'ordinanza del Sindaco di Genga vieta l'accesso nella Grotta del Fiume.