Dalla Cattedrale si accede al Santuario diocesano della Madonna detta di S. Giovanni, patrona della città dal 1893. 
La porta d'ingresso fu realizzata in rame da C. Capponi nel 1950. 
Il Santuario fu innalzato negli anni 1846-58 su progetto del fermano G. Carducci, e conserva all'interno 4 statue di Luigi Fontana, 5 lampadari di Murano e un coro ligneo a due ordini di S. Morelli di Montegiorgio. L'edicola che custodisce il miracoloso Simulacro, opera di S. Sebastiani, del 1620, fu progettata dall'architetto Francesco Vespignani nel 1881.