La struttura architettonica, progettata dall’architetto pontificio Luigi Vanvitelli, si trova nella parte più interna del porto naturale di Ancona in una posizione strategica e suggestiva all’esterno delle vecchie mura della città antica. A pianta pentagonale, la Mole era  una sorta di isola autosufficiente, collegata all’esterno solo da una piccola passerella. Una costruzione polifunzionale: lazzaretto di sanità pubblica, fortificazione a difesa del porto, deposito per le merci, protezione del porto dall'azione delle onde. Salvaguardava la salute pubblica ospitando depositi e alloggi per merci e persone in quarantena che arrivavano al porto da zone ritenute non sicure. Nel corso del tempo è stata usata anche come ospedale militare; poi è divenuta cittadella militare e in ultimo deposito di tabacchi. Oggi ospita mostre temporanee ed altri eventi culturali, oltre alla celebrazione di matrimoni civili.