Il santuario del Ss. Crocifisso dell'Icona era originariamente dedicato a S. Maria delle Grazie ed è significativo che ancor oggi si trovi all'altar maggiore un affresco staccato della Madonna con Bambino (Icona). Pure dedicata alla Vergine è la Madonna di Loreto e S. Nicola di Bari, opera attribuita a Sebastiano Ghezzi. Tuttavia, a partire dai primi del Seicento vi si venera il Crocifisso ligno policromo (di incerto autore) collocato all'interno di un altare barocco, e tale culto ha fatto mutare la declinazione del santuario. L'attuale chiesa fu eretta alla metà del Cinquecento, ma venne radicalmente rimaneggiata alla fine del XVII secolo e, ancora, nel 1780. 
Si devono a Lazzaro Giosafatti la ricostruzione della facciata, cupola e cappelle laterali. La pala d’altare raffigurante la Traslazione della S.Casa di Loreto e S.Nicola da Bari, olio su tela attribuito al veneziano Pietro Gaia.